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Modelação de Bioestruturas

MBPágina da Cadeira
6 ECTS1st SemesterExame: Obrigatório
Geral
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Carga de trabalho
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Descrição

Objetivos

Estudar propriedades físicas, químicas, biológicas e estruturais das proteínas e DNA. Conhecer os Princípios de catálise enzimática. Usar técnicas computacionais para o estudo e previsão das propriedades abordadas.

Programa

Programa das AULAS TEÓRICAS:

  1. Interações moleculares em química biológica.
  2. Biomoléculas- síntese, estrutura e propriedades.
  3. Dos aminoácidos às proteínas.
  4. Estrutura primária, secundária, terciária e quaternária de proteínas.
  5. Visualização e manipulação de estruturas de proteínas in silico.
  6. Catálise e inibição enzimática.
  7. Ácidos nucleicos.

Programa das AULAS PRÁTICAS:
I. Introdução geral ao LINUX.
II. Obtenção de informação científica - PDB (protein databank) - Artigos (Web of science) - Ferramentas de análise na web.
III. Técnicas básicas utilizadas na visualização e manipulação de modelos moleculares in silico (software: VMD).
IV. Estudo e manipulação gráfica de modelos de aminoácidos e proteínas.
V. Simulação computacional de Dinâmica Molecular no estudo da interação entre uma enzima e substrato. (software: Amber e VMD)
VI. Realização de um poster científico sobre uma estrutura proteica