Description
Objetivos
O principal objectivo deste curso é fornecer aos estudantes um conhecimento teórico sólido acerca dos princípios gerais e métodos utilizados em taxonomia microbiana (em particular de procariotas), encarada nas suas vertentes de classificação, identificação, diferenciação e nomenclatura, complementado por uma aplicação laboratorial de alguns dos principais métodos de diferenciação/classificação e identificação/diagnóstico utilizados actualmente em taxonomia bacteriana. Constituem objectivos adicionais a discussão da aplicabilidade dos conceitos e métodos em termos de taxonomia microbiana sensu lato e em termos de situações de ambiente real.
Programa
Curso teórico Introdução à Taxonomia. Conceitos básicos. Abordagens e evolução da taxonomia bacteriana. O conceito de espécie em microbiologia. Interacções e utilidade da taxonomia. Taxonomia Numérica. Princípios básicos. Métodos hierárquicos e não hierárquicos em taxonomia. Quimiotaxonomia. Princípios básicos e metodologias. Métodos analíticos de fingerprinting. Taxonomia Molecular. Princípios básicos. Filogenias. Marcadores filogenéticos e filogenias de genomas completos. Diversidade fenotípica e filogenias. Nomenclatura: princípios e regras básicas. Identificação e diagnóstico: abordagens fenotípicas e moleculares. Diferenciação e tipificação: métodos fenotípicos e moleculares. Epidemiologia e rastreabilidade. Abordagem polifásica. Curso prático Análise de dados em taxonomia numérica: os programas NTSYS-PC (Exeter) e BioNumerics (Applied Maths). Aplicação de métodos quimiotaxonómicos e moleculares de identificação e diferenciação de microrganismos seleccionados.